中国乌龙茶种质资源主要集中在闽北、闽南、广东、台湾这4个地区。该研究采用高通量SNP技术分析100个乌龙茶品种的遗传多样性。课题组前期已从茶树（Camilla sinensis）的表达序列标签（EST）数据库中验证了96对引物。该研究进一步筛选了75个SNP位点，准确有效地鉴定了乌龙茶种质之间的遗传关系。通过追踪SNP每个位点的信息，构建了4个主要乌龙茶产区的DNA指纹图谱。通过PCoA图谱，进化树和基于模型的结构图等图表的多样性分析，揭示了4个主要乌龙茶产区的遗传关系。其中，广东乌龙茶品种群体的基因型相对独立，台湾乌龙茶种质资源的基因型与福建相似。闽南和闽北的茶树的基因交流最多，但又有各自的特征倾向。

通过PCoA，基于贝叶斯方法的结构图和层级聚类树等方法对这100个品种进行分析和聚类，发现这些分析方法均将中国乌龙茶种质资源分为两组。一方面，广东乌龙茶品种独立发展。据中国茶树种植的历史记载，福建的茶树资源引自北部的浙江和江苏两省。广东省的茶树资源直接来自云南省往东的水陆运输进入，与福建乌龙茶资源种群是分别独立发展的。研究表明，广东和福建茶树品种的遗传距离大，验证了它们之间的来源差异。另一方面，台湾的茶叶种植面积相对较小，品种少，主要包括“金萱”、“青心乌龙”、“翠玉”、“四季春”等，文章选择这4个代表性的茶树品种进行研究。分析结果表明，台湾的品种资源被分类聚集到福建群体中，与福建的品种基因型十分接近。实验验证了台湾的茶树种质资源来源于福建的说法。在STRUCTURE图中，由于最佳k值为3，闽南群体与闽北群体之间存在明显差异，这在PCoA中也得到了验证。但总体来说，闽北和闽南的茶树品种资源基因交流密切。

聚类分析还揭示了几个品种的遗传背景。

（1）“铁观音”品种起源于安溪县，是福建省种植面积最大的乌龙茶品种。“铁观音”有两个起源故事，两株母树。对两个版本的母树样本进行SNP标记，发现它们的遗传相似性为100％。因此，可以确认“铁观音”茶树品种只有一种。

（2）“八仙茶”起源于福建省诏安县，前人指出其树型、树势、SSR基因型与广东乌龙茶种群相似。SNP实验结果表明，国家级茶树优良品种“八仙茶”被分类到粤东种群中，这说明闽粤边界也有茶树的遗传交换。

（3）“金钱”与“金凤凰”之间的亲属关系非常密切，这支持了“金凤凰”的父本可能是“金钱”这一假设。（假设基于“金凤凰”的母本是“凤凰水仙”，但是在武夷山选育而成，且它们的叶形皆是椭圆形。）这表明高通量SNP技术在寻找和验证茶树亲本关系方面具有很大的发展空间。

该研究探索了4个主要乌龙茶产区种质资源的遗传关系，为将来的乌龙茶茶树育种工作提供有效参考工具，对保护乌龙茶遗传多样性具有重要意义。

福建农林大学园艺学院茶学硕士研究生林浥为该论文的第一作者，叶乃兴教授、于文涛高级农艺师（博士）为该论文的通讯作者。福建农林大学为第一完成单位，福州海关技术中心、南京农业大学、武夷学院为合作完成单位。该研究得到了中国乌龙茶产业协同创新中心等项目经费的资助。